CONTENTS
- 1. 조세소송 | 정의
- - 조세소송의 구조, 원고와 피고 대상
- 2. 조세소송 | 대표적인 유형
- 3. 조세소송 | 조세불복제도
- - 이의신청
- - 심사청구
- - 심판청구
- - 행정소송(조세소송)
- 4. 조세소송 | 진행 절차
- 5. 조세소송 | 핵심 쟁점 및 주의사항
- - 나홀로 조세소송 대응 방법
- 6. 조세소송 | 쟁점
1. 조세소송 | 정의

조세소송은 납세자가 세금과 관련한 부당한 처분을 받았다고 판단할 때 이를 시정받기 위해 제기하는 소송 절차입니다.
대표적으로 세금 부과처분 취소소송이나 부과제척기간 경과 주장에 따른 무효확인소송, 환급세액 지급청구소송 등이 있습니다.
조세는 국가나 지방자치단체가 법률에 근거하여 국민에게 부과·징수하는 공과금인 만큼 이에 대한 불복절차도 엄격한 법적 구조 안에서 진행됩니다.
조세소송은 단순히 세금문제를 다루는 것이 아니라 헌법상 재산권 보장을 위한 중요한 권리구제 절차라는 점에서 매우 중요합니다.
조세소송의 구조, 원고와 피고 대상
조세소송은 일반 민사소송과는 달리 공권력의 작용에 대한 다툼이므로 행정소송법이 적용되며, 대개 항고소송(취소소송, 무효확인소송 등)으로 진행됩니다.
▶원고
조세소송의 원고는 국세, 지방세 및 관세 등 각종 조세 부과 처분에 대해 이의가 있는 납세자입니다.
세금 부과에 대해 불복할 경우, 조세소송을 통해 불합리하거나 과도한 세액에 대해 법적 판단을 요구할 수 있습니다.
원고는 개인 납세자 또는 법인일 수 있으며, 세금 부과나 처분에 대한 불만을 제기하는 경우, 이를 바로잡기 위해 조세소송을 제기할 수 있습니다.
▶피고
조세소송에서 피고는 세무 당국으로, 주로 국세청, 지방세청, 세관 등이 해당됩니다.
피고는 세금 부과 처분을 한 행정기관으로, 이들은 소송에서 자신의 처분이 정당하다고 주장하며 방어하게 됩니다.
조세소송의 피고는 세무 당국이지만 법적으로는 법원에서 처분의 적법성을 판가름하게 됩니다.
2. 조세소송 | 대표적인 유형

조세소송의 대표적인 유형에 대해 살펴보겠습니다.
1. 부과처분 취소소송
가장 일반적인 조세소송으로 세무서장이 부과한 세금이 위법하거나 부당하다고 판단될 경우 그 취소를 구하는 소송입니다.
예: A 기업이 부가가치세 신고를 정당하게 했음에도 불구하고, 세무서가 매출누락을 이유로 가산세까지 부과한 경우 이를 다투기 위해 부과처분 취소소송을 제기합니다.
2. 부과제척기간 경과 무효확인소송
세금 부과에는 일정한 법정 시한(부과제척기간)이 있습니다.
이 기간을 넘겨 부과한 처분은 무효가 될 수 있으며 이 경우에는 무효확인을 구하는 소송을 제기할 수 있습니다.
예: 세법상 5년의 제척기간이 경과한 뒤에 부과된 세금은 원칙적으로 무효입니다.
3. 환급세액 지급청구소송
납세자가 착오로 과다납부한 세금에 대해 환급을 청구했으나 과세관청이 이를 거부한 경우, 법원에 환급을 청구하는 소송을 제기할 수 있습니다.
예: 소득세 신고 후 소득금액 변경통지로 인해 실제 납부세액이 과다한 경우 환급을 요구할 수 있습니다.
4. 압류·공매 등 체납처분에 대한 집행정지 및 취소소송
세금 체납을 이유로 한 압류, 공매 등의 강제집행 절차가 위법하다고 판단될 경우 이를 정지시키거나 취소를 구하는 소송을 제기할 수 있습니다.
3. 조세소송 | 조세불복제도

조세소송을 제기할 수 있는 조세불복제도에 대해 살펴보겠습니다.
조세불복제도란 납세자가 세무서나 국세청 등 과세관청으로부터 부당한 세금 고지나 처분을 받았다고 생각할 때 그 처분을 시정해달라고 이의를 제기하는 제도입니다.
불복 절차는 크게 4단계로 이뤄집니다.
이의신청
-세무서장 또는 지방국세청장에게 제기
-선택 가능한 임의 절차
-처분 통지일부터 90일 이내 신청
-30일 내 결정 통지 (지연 시 후속 절차 가능)
심사청구
-국세청장 또는 감사원에 청구
-이의신청 없이도 직접 가능
-청구일로부터 90일 이내 결정
심판청구
-조세심판원에 청구
-역시 이의신청 없이 가능
-심판청구일로부터 90일 내 결정
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행정소송(조세소송)
-심사 또는 심판청구 후에도 해결되지 않은 경우 제기
-이의신청을 거쳤다면 감사원 심사청구는 선택 불가
-제소기간은 결정서 수령일 또는 결정기간 경과일부터 90일 이내
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4. 조세소송 | 진행 절차
조세소송 개요는 아래와 같습니다.
조세소송은 세금 문제에 대해 납세자와 과세관청이 의견 차이를 보일 때 법원에서 최종 판단을 받기 위해 진행하는 절차입니다.
세금을 많이 신고해서 더 낸 경우에는, 납세자가 돌려달라고 요청하는 경정청구를 하게 되며 이 요청이 받아들여지지 않으면 심판청구나 소송으로 이어질 수 있습니다.
반대로 세금을 적게 신고했을 경우에는 과세관청이 부족한 세금을 추가로 부과하는데 이에 대해 납세자가 이의가 있다면 불복절차를 거치거나 조세소송을 통해 다툴 수 있습니다.
조세소송은 보통 다음과 같은 흐름으로 진행됩니다.
1. 납세자(원고)가 법원에 소장 제출
2. 세금을 부과한 세무서장 또는 지방국세청장(피고)가 이에 대한 답변서 제출
3. 양측이 여러 차례 재판에서 주장과 증거를 내며 심리
4. 법원의 판결
▶조세소송은 3심제로 운영됩니다.
1심: 서울행정법원 또는 해당 지역 관할 지방법원
2심: 관할 고등법원
3심: 대법원
5. 조세소송 | 핵심 쟁점 및 주의사항
조세소송의 핵심 쟁점 및 주의사항에 대해 살펴보겠습니다.
▶사실관계 입증의 중요성
조세소송은 과세 관청의 처분이 위법하다는 점을 납세자가 입증해야 합니다.
매출·매입 내역, 회계장부, 계약서, 세금계산서, 이메일 등의 입증자료 확보가 매우 중요합니다.
▶법령 해석의 다툼
동일한 사실이라도 세법 해석에 따라 과세 여부가 달라질 수 있습니다.
특히 유권해석과 실무상 판례의 흐름을 파악하는 것이 중요합니다.
▶신의성실의 원칙
납세자가 세법상 규정을 알고도 위반한 사실이 입증될 경우 감액 사유가 되지 않으며, 부당한 감세 목적의 행위는 패소로 이어질 수 있습니다.
▶세무조사 단계부터 대응
조세소송은 통상 세무조사 단계에서 이미 과세 근거가 정리되기 때문에, 초기 단계부터 법률적 대응이 이뤄져야 유리합니다.
▶제소기간 엄수
법에서 정한 제소기간(90일)을 넘기면 소송 자체가 각하되므로 일정 관리가 매우 중요합니다.
나홀로 조세소송 대응 방법
조세소송은 전문성이 높은 영역이므로 가능하면 전문가의 조력을 받는 것이 바람직하지만, 일정한 요건을 갖춘다면 혼자서도 절차 진행이 가능합니다.
아래는 혼자 조세소송을 준비할 때 반드시 숙지해야 할 핵심사항입니다.
1. 전심절차 적법하게 거치기
조세소송을 제기하려면 심사 혹은 심판청구를 거친 뒤에만 제기할 수 있습니다.
접수일, 결정일, 재결서 수령일 등 모든 절차 이력을 증거로 확보해야 합니다.
2. 소 제기 기간 엄수
행정소송은 불변기간 규정이 적용되므로, 법정기간 내 제기하지 않으면 각하됩니다.
과세처분이 있음을 안 날로부터 반드시 90일 이내에 진행해야 합니다.
3. 소장 작성 시 유의사항
소장은 다음 요건을 충족해야 합니다.
-당사자, 주소, 처분청 명확히 기재
-처분의 구체적 내용 및 위법 사유 명시 (예: 사실오인, 절차위반, 재량권 일탈·남용 등)
-증빙자료 첨부 (세금계산서, 금융거래 내역, 계약서 등)
-전심절차 거친 사실 명시
4. 관련 증거의 체계적인 확보와 정리
조세소송의 핵심은 ‘입증’입니다. 주장을 뒷받침할 수 있는 증빙자료는 다음과 같습니다.
-세금계산서, 거래명세서, 계약서, 통장거래내역, 이메일 등
-부동산 등기부등본, 양도소득 계산 내역, 매수자 확인서
-세무신고서, 부가가치세 신고 내역, 장부 사본
자료는 사안별로 다르며, 전자파일 형태로 정리해두면 제출 및 보관에 유리합니다.
5. 판례 검색 및 주장 정리
스스로 소송을 준비할 때는 유사 판례를 확인하여 주장의 근거를 마련하는 것이 중요합니다.
국가법령정보센터, 대법원 종합법률정보 사이트에서 다음 내용을 중심으로 검색합니다.
-유사 세목의 과세취소 사례
-입증 부족 또는 위법 절차로 인한 처분 취소 사례
-실질과세원칙 위반 인정 사례
주장은 논리적으로 정리하고, 숫자 계산 또는 법령 적용에 오류가 없도록 철저히 검토해야 합니다.
6. 조세소송 | 쟁점
조세소송은 다른 일반 행정소송이나 민사소송과 비교해 다음과 같은 구조적·법리적 특징을 지니며 그로 인해 독특한 쟁점이 발생합니다.
이러한 쟁점들은 단순한 주장 대립을 넘어 세법 해석, 입증의 구조, 사실 판단과 세법 적용의 정합성 등을 종합적으로 판단해야 하는 고난도의 법률적 문제로 이어지기 때문에 실무에서는 조세 전문 로펌의 조력이 특히 중요하게 작용합니다.
2. 세법 해석의 불명확성과 위법성 판단
3. 세무조사 절차 위법성과 실질심리의 접점
4. 형사절차와의 연계 문제
조세소송은 단순히 ‘세금이 억울하다’는 감정적 주장만으로는 승소할 수 없는 고도의 전문 법률 영역입니다.
과세관청의 처분은 법률에 기반한 행정행위이므로 이에 대한 반박 역시 법리적 구조와 사실관계 입증이 정교하게 결합되어야만 의미 있는 결과를 이끌어낼 수 있습니다.
특히 입증책임의 부담, 세법 해석의 복잡성, 형사처벌 연계, 조사절차 위법성의 증명 등 조세소송에서 빈번하게 등장하는 핵심 쟁점들은 납세자가 혼자 대응하기에는 구조적 한계가 있습니다.
본 법인은 조세전문변호사, 행정전문변호사가 로펌 소속 세무사와 함께 협업해 세무조사 대응, 조세심판 전략 수립, 형사방어 연계, 증거정리, 판례 분석 및 논리적 주장 구조 설계 등 조세소송 원스톱 법률 서비스를 제공하고 있습니다.